בספר זה מתגלים הסודות של בית הכלא המרכזי בירושלים בתקופה שלפני קום המדינה, תקופה שבה שלטו הבריטים בארץ ישראל ושבה נכלאו לוחמי המחתרות היהודיות מאחורי הסורגים.
ב״מחתרות במאסר״, ההיסטוריון זאב גולן מזהה לראשונה את התאים שבהם ישבו זאב ז׳בוטינסקי, אברהם שטרן, דוד רזיאל, פנחס ספיר, אורי צבי גרינברג ואבא קובנר, ומספר על פעילותם בעת שישבו בכלא.